Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC9Q6ZRR7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms