Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMIGD1Q6UXZ0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMIGD1Q6UXZ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms