Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED9Q6R2W3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms