Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC174Q6PII3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms