Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC3HQ6NTF7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC3HQ6NTF7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms