Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIGD3Q6B0B8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms