Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GKAP1Q5VSY0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms