Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDSS1Q5T2R2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms