Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms