Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAVIN4Q5BKX8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAVIN4Q5BKX8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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