Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms