Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFTN2Q52LD8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFTN2Q52LD8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms