Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms