Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFAP100Q494V2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFAP100Q494V2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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