Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms