Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL38Q2WGJ6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms