Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CCDC96Q2M329 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CCDC96Q2M329 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CCDC96Q2M329 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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CCDC96Q2M329 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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