Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC27Q2M243 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms