Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MICAQ29983 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MICAQ29983 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms