Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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