Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2SQ16763 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2SQ16763 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms