Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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