Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRA6Q16445 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms