Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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