Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms