Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SCN9AQ15858 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SCN9AQ15858 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SCN9AQ15858 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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