Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TAF1AQ15573 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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