Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIV2LQ15477 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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