Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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