Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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RYR3Q15413 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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RYR3Q15413 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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RYR3Q15413 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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