Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PUM3Q15397 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUM3Q15397 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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