Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3CQ15386 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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UBE3CQ15386 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBE3CQ15386 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE3CQ15386 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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