Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF1Q15361 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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TTF1Q15361 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TTF1Q15361 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TTF1Q15361 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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TTF1Q15361 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF1Q15361 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TTF1Q15361 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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TTF1Q15361 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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TTF1Q15361 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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