Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRKQ15262 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRKQ15262 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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