Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRRQ15256 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRRQ15256 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRRQ15256 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRRQ15256 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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