Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDK5R1Q15078 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDK5R1Q15078 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDK5R1Q15078 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDK5R1Q15078 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDK5R1Q15078 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CDK5R1Q15078 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CDK5R1Q15078 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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