Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCAPD2Q15021 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms