Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GAPVD1Q14C86 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GAPVD1Q14C86 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
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