Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM29Q14134 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM29Q14134 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms