Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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COL9A2Q14055 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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