Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms