Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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