Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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