Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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