Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MSLNQ13421 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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