Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PMS2P3Q13401 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P3Q13401 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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