Protein–RNA interactions for Protein: Q13239

SLA, Src-like-adapter, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAQ13239 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLAQ13239 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLAQ13239 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLAQ13239 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLAQ13239 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLAQ13239 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLAQ13239 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms