Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms