Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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IFT88Q13099 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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IFT88Q13099 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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IFT88Q13099 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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IFT88Q13099 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFT88Q13099 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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