Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms